Химийн тэнхим дээр мэргэших чиглэлийн дагуу судалгаа, шинжилгээний ажил явуулдаг тодорхой бүтэц зохион байгуулалт үүссэн. Үүнд:
Орчны шинжилгээний судалгааны баг
Химийн хэмжил зүй, Хөрсний хими Гадаргын, гүний, нуурын болон хаягдал усны гидрохимийн судалгаа, Хүрээлэн буй орчны бохирдол (органик ба органик бус)-ын үнэлгээ, Хүрээлэн буй орчны бохирдолыг бууруулах судалгаа, Биологийн объёоктын элементийн анализ, Ажлын байрны агаарын судалгаа
Эрдэс түүхий эдийн химийн болон биологийн уусалт, дэвшилтэт материалын судалгааны баг
Адсорбцийн процессийн физик химийн судалгаа, Усан орчин дах металл ионы электрохимийн судалгаа, Химийн урвалын кинетикийн судалгаа, Квант химийн болон онолын тооцоолол
Химийн дидактикийн судалгааны баг
Химийн боловсрол
Эмчилгээний хүнс, байгалийн нэгдэлийн судалгааны баг
Функциональ хүнсний хими-биотехнологи, Эмийн ба ашигт ургамлын фитохими
Цэвэр энергийн технологи хөгжүүлэлтийн баг
Хий, шингэн ба хатуу шатах ашигт малтмалын бүтэц, шинж чанарын судалгаа; ашиглалт ба боловсруулалтын цэвэр технологи
Биологын идэвхит байгалийн нэгдлийн химийн судалгааны баг
Фитохими, ургамлын болон мөөгний биологийн идэвхит нэгдлийн судалгаа, мөөг тарималжуулах
Органик синтез, наноматериалын судалгааны баг
Органик синтез, наноматериалын судалгааны баг
